في إطار السعي إلى توسيع إشعاع جامعة الزيتونة، وتدعيم البحث العلمي بها، تم بعث ست وحدات بحث بها، أربعة منها ترجع بالنظر إلى المعهد العالي لأصول الدين، وواحدة تتبع المعهد العالي للحضارة الإسلامية، وأخرى تتبع مركز الدراسات الإسلامية بالقيروان، وهي وحدة بحث تاريخ القيروان.

    تأسست هذه الوحدة سنة 2001، وأشرف عليها في مرحلة أولى الأستاذ الدكتور سالم بويحي، رئيس جامعة الزيتونة حاليا، ثم أحيلت رئاستها منذ سنة 2004 إلى الدكتور نجم الدين الهنتاتي، أستاذ تعليم عال بالمعهد العالي للحضارة الإسلامية.

 أعضاء الوحدة

    وهي تضم عددا من الأساتذة الجامعيين والطلبة الباحثين، ينتمي عدد منهم إلى جامعة الزيتونة، وعدد آخر إلى كليات ومعاهد أخرى، وهم على التوالي:

 السادة الأساتذة:

- عامر ونيس (جامعة الزيتونة)

- درة بن سدرين (جامعة الزيتونة)

- عمار العشي (جامعة الزيتونة، كلية الآداب والفنون والإنسانيات بمنوبة)

- فوزي محفوظ (كلية الآداب والفنون والإنسانيات بمنوبة)

- صادق عمران (كلية العلوم الإنسانية والاجتماعية بتونس)

- حفيظ طبابي (معهد الحركة الوطنية)

- نهاد بن شعبان (المعهد العالي لتكنولوجيات البيئة والعمران والبنيان بتونس)

- علي ساسي (أستاذ مساعد ملحق بوزارة الثقافة والمحافظة على التراث)

- إبراهيم السعداوي (كلية الآداب بجندوبة)

- علي المنصوري (المعهد الوطني للتراث).

السادة الطلبة:

- صالح عثمان صلاح الدين (جامعة الزيتونة)

- سالم الرواحي (جامعة الزيتونة)

- بسمة بلحاج (جامعة الزيتونة)

- عدنان بن عرفي (كلية الآداب والفنون والإنسانيات بمنوبة)

- العربي عربي الصغير (كلية الآداب والفنون والإنسانيات بمنوبة)

- عبد الحميد بحروني (كلية الآداب والفنون والإنسانيات بمنوبة)

- رضا جوادي (كلية العلوم الإنسانية والاجتماعية تونس)

- خولة صدام (كلية الآداب بالقيروان).